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试管婴儿男孩女孩是百发百中吗？技术上是肯定的。三代试管婴儿技术可用于选择生男孩女孩，技术上可达百发百中。但我国现行政策不允许无医学指征的性别选择。因此，目前三代试管婴儿技术的目的不是选择性别，而是筛选致病基因，阻断致病基因及其后代的传播。一些特殊患者，如Y染色体微缺乏，生男孩会患上这种疾病，所以这些患者会建议性别筛查，选择女孩。
理论上，试管受精可以是性别选择性的。试管受精的性别选择通常是针对女性或男性的遗传疾病。这些遗传因素不想被遗传给后代。遗传因素可以通过人工方法阻断，并可以在胚胎植入前进行筛选。一些遗传疾病与性有关。胚胎植入前的性别筛查可以阻止这种遗传风险，需要医学指征，即医学指征下的性别筛查。
除了性连锁遗传引起的性别选择外，试管婴儿技术不能在没有适应症的情况下进行性别鉴定和选择。一些遗传疾病的发病率与性别高度相关，如男性或女性，称为性连锁遗传疾病。
第三代体外受精是指植入前的基因检查，包括植入前遗传学的筛查和诊断。该技术的主要目的是检查胚胎。检测并破坏一些非整倍体胚胎和遗传基因异常胚胎，植入正常胚胎。因为有些遗传疾病与性别有关，即染色体上的异常基因，有些异常需要性别筛查。这种筛选可以通过第三代技术进行。但它需要遵守医学指示。
通过第三代试管婴儿技术，PGT-M可以筛选无致病基因的胚胎进行移植。这个时候可以考虑性别选择。在临床上，这项技术可以用来阻断许多性连锁遗传疾病的遗传，如血友病和克氏综合征。否则，我国禁止无指征使用试管婴儿技术进行性别选择。
